Η σήψη και οι ασθενείς με Covid σε κίνδυνο προβλέφθηκαν με γενετικό μοντέλο

Ερευνητές του Ινστιτούτου Wellcome Sanger, του Πανεπιστημίου της Οξφόρδης, του Πανεπιστημίου Queen Mary, του Imperial College και του Πανεπιστημίου της Οξφόρδης ανέπτυξαν ένα νέο μοντέλο για να κατανοήσουν ποιοι ασθενείς με σήψη, Covid-19 και γρίπη έχουν μειωμένη λειτουργία του ανοσοποιητικού συστήματος και είναι πιο πιθανό να έχουν φτωχότερους αποτελέσματα.. Συνεργάτες

Η μελέτη, που δημοσιεύθηκε σήμερα (2 Νοεμβρίου 2022) στο Science Translational Medicine, εντόπισε 19 γονίδια που προβλέπουν πώς το ανοσοποιητικό σύστημα ανταποκρίνεται στη σήψη, τον Covid-19 και τις λοιμώξεις της γρίπης και πώς η ανοσολογική απόκριση μπορεί να πάει στραβά σε μερικούς ανθρώπους. να είναι Ο μικρός αριθμός γονιδίων που χρησιμοποιούνται σε αυτό το μοντέλο ανοίγει το δρόμο για τεχνικές ιατρικής ακριβείας, όπως η ιεράρχηση των ανθρώπων για συγκεκριμένες παρεμβάσεις, για ασθένειες όπως η σήψη που είναι δύσκολο να διαγνωστούν και να αντιμετωπιστούν.

Η σήψη προκαλείται από μια «ακατάλληλη» ανοσοαπόκριση σε μόλυνση ή τραυματισμό που μπορεί να εξαπλωθεί σε όλο το σώμα. Για άγνωστους λόγους, στη σήψη, η ανοσολογική απόκριση γίνεται υπερδραστήρια ή υποενεργή, προκαλώντας βλάβη στα υγιή κύτταρα, όχι μόνο στην πηγή της μόλυνσης. Είναι δύσκολο να προβλεφθεί ποιος θα αναπτύξει σήψη, ποιος θα αναρρώσει και ποιος θα έχει κακή έκβαση όπως το σύνδρομο μετά τη σήψη (PSS) και ο θάνατος. Σε παγκόσμιο επίπεδο, υπολογίζεται ότι υπάρχουν περίπου 49 εκατομμύρια περιπτώσεις σήψης και 11 εκατομμύρια θάνατοι ετησίως.1.

Παρά τις εκατοντάδες κλινικές δοκιμές που στοχεύουν στη βελτίωση των αποτελεσμάτων της σήψης, δεν υπάρχει προς το παρόν στοχευμένη θεραπεία. Επειδή η σήψη μπορεί να αναπτυχθεί για πολλούς λόγους, είναι μια πολύ μεταβλητή ασθένεια και τα θετικά αποτελέσματα από ορισμένες δοκιμές φαρμάκων δεν έχουν αναπαραχθεί σε άλλες.

Η καλύτερη κατανόηση της σήψης σε μοριακό επίπεδο, έτσι ώστε οι ασθενείς να μπορούν να ταξινομηθούν με βάση τα ειδικά χαρακτηριστικά της ασθένειάς τους, θεωρείται ότι είναι το κλειδί για μεγαλύτερη επιτυχία στον εντοπισμό εκείνων που κινδυνεύουν και στην ανάπτυξη αποτελεσματικών θεραπειών.

Σε αυτή τη νέα μελέτη, ερευνητές από το Ινστιτούτο Wellcome Sanger και το Πανεπιστήμιο της Οξφόρδης ξεκίνησαν να αναπτύξουν ένα μοντέλο γονιδιακής έκφρασης για να κατανοήσουν ποιοι ασθενείς με σήψη είναι πιο πιθανό να έχουν συγκεκριμένες απαντήσεις και δυνητικά φτωχά αποτελέσματα.

Περιλάμβανε 1.655 δείγματα από ασθενείς με σήψη που συλλέχθηκαν ως μέρος της Μελέτης Γονιδιωματικής Προόδου στη Σήψη του Ηνωμένου Βασιλείου, τα οποία στη συνέχεια αναλύθηκαν στην αλληλουχία στο Ινστιτούτο Wellcome Sanger για τον εντοπισμό εκφρασμένων γονιδίων. Στη συνέχεια τα δεδομένα που ελήφθησαν συνδυάστηκαν με τα διαθέσιμα δεδομένα από ασθενείς με σήψη και υγιή άτομα.

Η ανάλυση αυτών των δεδομένων εντόπισε μοτίβα γονιδιακής έκφρασης ενδεικτικά μιας ακατάλληλης ανοσολογικής απόκρισης, επιτρέποντας στους ερευνητές να προβλέψουν τα κλινικά αποτελέσματα από μια ομάδα μόλις 19 γονιδίων.

Ο καθηγητής Τζούλιαν Νάιτ, επικεφαλής συγγραφέας της μελέτης από το Πανεπιστήμιο της Οξφόρδης, δήλωσε: «Χρειαζόμαστε επειγόντως καλύτερους τρόπους για να κατανοήσουμε τι προκαλεί το ανοσοποιητικό σύστημα να ανταποκριθεί στη μόλυνση και να προκαλέσει σήψη, μια ασθένεια με καταστροφικές συνέπειες. Για εκατομμύρια ανθρώπους. Ένα γρήγορο και ακριβές τεστ κάθε χρόνο παγκοσμίως για την πρόβλεψη του ποιος έχει έναν συγκεκριμένο τύπο ανοσοαπόκρισης στη λοίμωξη και ποιος διατρέχει μεγαλύτερο κίνδυνο χειρότερων εκβάσεων στη σήψη θα ήταν πολύ σημαντικός και τώρα φαίνεται μια πραγματική πιθανότητα.

Για να μετρηθεί εάν το μοντέλο των 19 γονιδίων μπορεί να εφαρμοστεί σε άλλες ασθένειες, αναπτύχθηκε ένα πλαίσιο μηχανικής μάθησης για να το δοκιμάσει στη σήψη, τον SARS-CoV-2 και τη γρίπη. Το μοντέλο ήταν σε θέση να προβλέψει με επιτυχία την πιθανότητα ενός ατόμου για κακή έκβαση και για τις τρεις ασθένειες.

«Τώρα που έχουμε τη δυνατότητα να προβλέψουμε την έκβαση της σήψης από μόλις 19 γονίδια, είναι σημαντικό όσο το δυνατόν περισσότεροι ερευνητές να το εκμεταλλευτούν», δήλωσε ο συγγραφέας της μελέτης Δρ Έντι Κάνο-Γκέιμς από το Πανεπιστήμιο της Οξφόρδης και το Wellcome. Ινστιτούτο Sanger. Από αυτήν την προσέγγιση, για να το διευκολύνουμε, δημιουργήσαμε ένα πακέτο κώδικα που επιτρέπει σε άλλους ερευνητές να εκτελέσουν το μοντέλο με τα δικά τους δεδομένα. Έχει σχεδιαστεί για να είναι εύκολο στη χρήση, ανεξάρτητα από την τεχνολογία που χρησιμοποιήθηκε για τη δημιουργία των δειγματοληπτικών δεδομένων.

Το επόμενο βήμα για τους ερευνητές είναι να κατανοήσουν περισσότερα σχετικά με τη δυσλειτουργία του ανοσοποιητικού συστήματος που εμπλέκεται στη σήψη και να συνεργαστούν με συναδέλφους για την ανάπτυξη κλινικών δοκιμών που βασίζονται σε βιοδείκτες. Ο στόχος αυτής της εργασίας είναι να βοηθήσει στη στόχευση των πιο αποτελεσματικών θεραπειών σε εκείνους που θα ωφεληθούν περισσότερο, για παράδειγμα χρησιμοποιώντας τον τύπο του μοντέλου 19 γονιδίων που αναπτύχθηκε σε αυτή τη μελέτη.

«Η σήψη φαινόταν εδώ και πολύ καιρό ως ένα δυσεπίλυτο πρόβλημα, επειδή δεν καταλάβαμε την ασθένεια όσο έπρεπε», δήλωσε η επικεφαλής συγγραφέας της μελέτης, Δρ Έμα Ντάβενπορτ από το Ινστιτούτο Wellcome Sanger. Ομοίως, τα πρώτα στάδια της πανδημίας του Covid-19 αποκάλυψαν ότι οι γιατροί βρίσκονταν υπό πίεση καθώς προσπαθούσαν να θεραπεύσουν ασθενείς χωρίς σταθερά δεδομένα για να εντοπίσουν αυτούς που κινδυνεύουν περισσότερο. Το μοντέλο μας παρέχει ένα επίπεδο λεπτομέρειας που θα μας επιτρέψει τελικά να αρχίσουμε να αναπτύσσουμε τεχνικές ιατρικής ακριβείας για τη σήψη και τη βελτίωση των αποτελεσμάτων για τους ασθενείς.

/ Δημόσια έκδοση. Αυτό το υλικό από τον αρχικό οργανισμό/συγγραφέα μπορεί να είναι ad hoc, επεξεργασμένο για λόγους σαφήνειας, στυλ και έκτασης. Οι απόψεις και οι απόψεις που εκφράζονται είναι αυτές των συγγραφέων. Δείτε αναλυτικά εδώ.

Leave a Comment