Η μικροβιακή μεταμόσχευση κοπράνων δεν παρουσιάζει προβλεψιμότητα όταν δεν έχει δοθεί προηγούμενη αντιβιοτική αγωγή στον λήπτη

ΜΠΕΡΜΙΝΓΧΑΜ, Αλά — Η μικροβιακή μεταμόσχευση κοπράνων — η παροχή κοπράνων από έναν δότη για την αλλαγή της μικροβιακής κοινότητας του εντέρου του λήπτη στο κόλον — ήταν η τελευταία επιτυχημένη θεραπεία για άτομα με υποτροπιάζουσες λοιμώξεις από Clostridium difficile μετά από πολλαπλούς κύκλους κατασταλτικών αντιβιοτικών. Η μικροβιακή κοινότητα αφαίρεσε τον υποδοχέα.

Ωστόσο, η μεταμόσχευση μικροβίων κοπράνων έχει επίσης διεξαχθεί για να αλλάξει το μεταβολισμό του λήπτη για τη μείωση της παχυσαρκίας ή την αλλαγή της ανοσίας για την καταπολέμηση του καρκίνου, και σε αυτά τα μοσχεύματα δεν χορηγούνται κατασταλτικά αντιβιοτικά στους λήπτες για την εξάλειψη της μικροβιακής κοινότητας πριν από τη μεταμόσχευση. Σε αυτές τις περιπτώσεις, η αρχική κοινότητα του εντέρου μετά τη μεταμόσχευση είναι μια κοινοπραξία μικροβίων δότη και λήπτη που πρέπει να εισέλθουν σε μια καθιερωμένη κοινότητα ως νέα μικροβιακά στελέχη.

Ερευνητές στο Πανεπιστήμιο της Αλαμπάμα στο Μπέρμιγχαμ αναφέρουν τώρα στο περιοδικό PLOS One ότι, ελλείψει προϋπόθεσης για τη μείωση της μικροβιακής κοινότητας του λήπτη, τα μικροβιακά μοσχεύματα κοπράνων δεν έχουν την προβλεψιμότητα να αλλάξουν τη μικροβιακή κοινότητα του εντέρου ώστε να ταιριάζει με τον δότη. Αυτό έρχεται σε αντίθεση με τη μικροβιακή μεταμόσχευση κοπράνων του C. difficile μετά από αντιβιοτική κατασταλτική θεραπεία, όπου παρατηρείται μακροχρόνιος αποικισμός στελεχών δότη έως και δύο χρόνια μετά τη μεταμόσχευση.

Ο ερευνητής του UAB, Hyunmin Koo, Ph.D., δήλωσε: «Η πρακτική μετάφραση της ανάλυσής μας προτείνει τη χρήση θεραπειών μικροβιακής μεταμόσχευσης πριν από τα κόπρανα για τη μείωση των μικροβιακών κοινοτήτων λήπτη για τη διευκόλυνση μιας μικροβιακής κοινότητας του εντέρου που κυριαρχείται από δότες μετά τη μεταμόσχευση μικροβίων κοπράνων. και Casey Morrow, Ph.D. Επιπλέον, η διαχρονική δειγματοληψία μεμονωμένων ασθενών με μεταμόσχευση μικροχλωρίδας κοπράνων σε συνδυασμό με ανάλυση ιχνηθέτη στελεχών για την παρακολούθηση της κατάστασης της μικροβιακής κοινότητας μικροχλωρίδας μετά τα κόπρανα είναι επίσης σημαντική για την αξιολόγηση της σταθερότητας και, τελικά, της επιτυχίας της μεταμόσχευσης μικροχλωρίδας κοπράνων. “

Οι Ku και Morrow ανέλυσαν τη μεταγονιδιωματική αλληλουχία που δημοσιεύτηκε από τους Davar et al. στην Επιστήμη το 2021, χρησιμοποιώντας δύο μεθόδους παρακολούθησης στελεχών, τη μέθοδο παρακολούθησης στελέχους WSS που αναπτύχθηκε στο UAB και το εργαλείο γονιδιωματικής πληθυσμού σε επίπεδο στελέχους StrainPhlAn. Το WSS μπορεί να ανιχνεύσει εάν ένα στέλεχος δότη ή ένα στέλεχος λήπτη ενός συγκεκριμένου είδους μικροβίων του εντέρου κυριαρχεί μετά τη μεταμόσχευση μικροβίων κοπράνων και το StrainPhlAn παρέχει ένα φυλογενετικό δέντρο μικροβίων που σχετίζονται με τον δότη ή τον λήπτη.

Το πάνελ μεταμόσχευσε μικροχλωρίδα κοπράνων από ασθενείς που ανταποκρίθηκαν στην ανοσοθεραπεία με αντι-PD-1 για μελάνωμα σε ασθενείς λήπτες που ήταν ανθεκτικοί στην ανοσοθεραπεία, καθώς η σύνθεση μικροχλωρίδας του εντέρου είχε αποδειχθεί ότι συσχετίζεται με την αποτελεσματικότητα αντι-PD-1. 1 Θεραπεία σε ζωικά μοντέλα και ασθενείς με καρκίνο. 6 στους 15 ασθενείς ωφελήθηκαν.

Οι Ku και Morrow ανέλυσαν πέντε μικροβιακά μοσχεύματα κοπράνων από μια ομάδα διαιτητών στην οποία η μικροχλωρίδα του λήπτη λήφθηκε πολλαπλές δειγματοληψίες σε μια περίοδο 535 ημερών μετά τη μικροβιακή μεταμόσχευση κοπράνων. Αυτά τα δημοσιευμένα μεταγονιδιωματικά δεδομένα επιτρέπουν την ανάλυση ιχνηλάτησης στελεχών χρονοσειρών.

Οι ερευνητές του UAB διαπίστωσαν ότι τρία είδη Alistipes και ένα είδος Parabacteroides είχαν όλα μοτίβα μικροβιακής συσχέτισης μετά τα κόπρανα των κυρίαρχων στελεχών δότη ή λήπτη στα κόπρανα.

Αντίθετα, το Bacteroides uniformis και το Bacteroides vulgatus εμφάνισαν δια-ατομικές διακυμάνσεις με την πάροδο του χρόνου με την εμφάνιση υπεροχής της πίεσης απέκκρισης ή υποδοχέα. Επιπρόσθετα στην πολυπλοκότητα, υπήρξαν περιπτώσεις κυρίαρχων στελεχών των δύο ειδών Bacteroides που δεν είχαν σχέση με τα στελέχη δότη ή λήπτη. Επίσης, ένα στέλεχος Bacteroides vulgatus έδειξε ένα πιθανό γεγονός γενετικού ανασυνδυασμού μεταξύ στελεχών δότη και λήπτη.

«Τα πολύπλοκα κυμαινόμενα μοτίβα εμφάνισης κυρίαρχων στελεχών δότη, λήπτη ή άσχετων κοπράνων μετά από μεγάλους χρόνους μεταμόσχευσης μικροβίων κοπράνων παρέχουν νέες γνώσεις για τη δυναμική των αλληλεπιδράσεων της μικροβιακής κοινότητας με τους λήπτες μετά τη μεταμόσχευση μικροβίων κοπράνων», είπε ο Morrow. «Το αποτέλεσμα της ανάλυσής μας έχει συνέπειες για τη χρήση μικροβιακής μεταμόσχευσης κοπράνων για να αλλάξει προβλέψιμα τις βιολογικές λειτουργίες της εντερικής κοινότητας στον μεταβολισμό και την ανοσία του ξενιστή».

Ο Morrow είναι ομότιμος καθηγητής στο Τμήμα Κυτταρικής, Αναπτυξιακής και Ολοκληρωτικής Βιολογίας του UAB και ο Kuo είναι συνεργάτης βιοπληροφορικής στο Τμήμα Γενετικής του UAB. Και τα δύο τμήματα βρίσκονται στο Marnix E. Heersink School of Medicine.

/ δημόσια κυκλοφορία. Αυτό το υλικό από τον αρχικό οργανισμό/συγγραφέα μπορεί να είναι ad hoc, επεξεργασμένο για λόγους σαφήνειας, στυλ και έκτασης. Οι απόψεις και οι απόψεις που εκφράζονται είναι αυτές των συγγραφέων. Δείτε αναλυτικά εδώ.

Leave a Comment